作为系统盘中的核心文件，MSDos。系统启动时，SYS是必不可少的。在DOS操作系统时代，主要负责创建、删除、读写磁盘文件的管理，内存管理，磁盘等系统资源管理。
在MS-DOS 6.x及以下版本中，MSDOS。SYS是一个非常重要的启动文件。但是，在MS-DOS 7.x的版本中，MSDOS。SYS变成了一个设置文件，有点类似于CONFIG。SYS，
它仍然有很大的作用。
MSDOS的功能。Win9X中的SYS，MSDOS。SYS成为一个纯文本的系统配置文件，用来控制Win的启动模式。您可以在DOS模式下删除其特殊属性(只读、隐藏、系统)，并根据您的需要进行配置。
MSDOS。SYS可以是一个空文件，甚至可以被删除。当然，此时系统只能以纯DOS模式启动，无法进入GUI系统。
当SYS用于将系统转移到硬盘修复启动文件时，引导记录IO。SYS和COMMAND.COM将被覆盖，MSDOS的内容也将被覆盖。SYS将保持不变，以保证系统的引导部分修复后，整个系统仍能正常启动。
MSDOS中[选项]块中的一些设置。Windows98的SYS文件。
[Options]AutoScan=1/0BootDelay=2/?BootGUI=1/0BootKeys=1/0BootMenu=0/1BootMenuDefault=1/2/3/4/5/6/7BootMulti=0/1BootWarn=1/0BootWin=1/0DblSpace=0/1DoubleBuffer=0/1DrvSpace=0/1Load Top=1/0Logo=1/0WinVer=4.10.1998
